1. Curso de Metabolômica

2. Curso Analítica: Dominando o Proteome Discoverer™ — Do Básico ao Avançado

Este curso foi desenhado para pesquisadores e profissionais que desejam dominar o software Proteome Discoverer™ (PD), sendo ideal tanto para iniciantes quanto para usuários de outros softwares (como MaxQuant e Spectronaut) que buscam migrar para a plataforma da Thermo Fisher.

Aprenda a ir além das configurações padrão, entendendo os parâmetros críticos que definem a qualidade da identificação e quantificação de proteínas.

O que você vai aprender:

Público-Alvo

Pesquisadores, pós-graduandos e profissionais de bioinformática/proteômica que utilizam ou desejam migrar para o Proteome Discoverer™, buscando fluxos de trabalho mais rápidos, modernos e precisos.

Diferencial: Curso focado na prática, com análise de dados reais e fornecimento de templatesde workflows otimizados para uso imediato no seu laboratório.

3. Curso da Waters: Metabolômica Aplicada por Espectrometria de Massas de Alta Resolução.

A metabolômica é uma ferramenta poderosa para compreender processos biológicos e identificar biomarcadores. Neste curso, serão abordados os principais aspectos práticos da análise metabolômica utilizando espectrometria de massas de alta resolução. Os participantes aprenderão sobre desenho experimental, preparo de amostras, cromatografia líquida, aquisição e processamento de dados, além de discutir estratégias para superar desafios comuns. Também serão apresentadas as inovações mais recentes da Waters, que ampliam a precisão e a eficiência das análises metabolômicas. O curso é voltado para profissionais e pesquisadores que desejam aprofundar seus conhecimentos e aplicar soluções práticas em seus projetos”

4. Curso Proteômica Além dos Organismos Modelo: Desafios e Oportunidades na Biodiversidade

Objetivo

Apresentar os fundamentos, desafios e oportunidades da identificação proteica em organismos não modelo e comunidades biológicas complexas, com foco em metaproteômica. A disciplina enfatiza as limitações das buscas convencionais dependentes de bancos de dados, o uso do sequenciamento de novo de peptídeos e aplicação de alinhamentos por similaridade para recuperar informação biológica em sistemas com genomas ausentes, incompletos ou pouco anotados.

Ementa

Diversidade proteômica além dos organismos modelo. Sub-representação de genomas e proteomas públicos. Princípios de LC-MS/MS, fragmentação de peptídeos, íons b/y e tags de sequência. Sequenciamento de novo como estratégia independente de banco de dados. Busca convencional, busca tolerante a erro e busca por similaridade. Uso do NOVOR para geração de sequências candidatas e do MS-BLAST para identificação por homologia. Critérios de seleção de peptídeos, curadoria de resultados, coerência taxonômica e interpretação crítica em metaproteômica.

Programa analítico

1. Proteômica da biodiversidade e organismos não modelo: lacunas dos bancos de dados, organismos não canônicos, comunidades complexas e conceito de “unknome”.

2. Fundamentos de LC-MS/MS e de novo sequencing: proteômica bottom-up, espectros MS/MS, fragmentação CID/HCD, séries b/y, perdas neutras, ambiguidades e peptide sequence tags.

3. Busca convencional versus busca por similaridade: limitações de Mascot/Sequest/engines convencionais diante de polimorfismos, múltiplos mismatches, erros de anotação e bancos incompletos.

4. Prática I – Softaware de novo a definir: preparação de arquivos, configuração geral, execução do sequenciamento de novo, leitura do output e seleção de peptídeos candidatos por qualidade, comprimento, redundância e presença de ambiguidades.

5. Prática II – MS-BLAST e metaproteômica: organização dos peptídeos selecionados, submissão/planejamento da busca por similaridade, interpretação de HSPs, alinhamentos, mismatches, coerência taxonômica e riscos de falsos positivos.

6. Discussão final: boas práticas para rastreabilidade, documentação e comunicação de identificações por homologia em metaproteômica.

Metodologia

Aula expositiva dialogada, demonstração orientada e atividade prática supervisionada. Os participantes acompanharão uma rotina mínima de análise: geração de sequências candidatas no NOVOR, curadoria dos peptídeos de maior qualidade e preparação/interpretação de alinhamentos por MS-BLAST aplicados à metaproteômica.